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跨學門科學人才培育銜接計劃
B-6子計畫
拷貝數多型性之偵測與連鎖不平衡分析

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 B類子計畫

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  • 計畫主持人:黃耀廷
    職  稱: 資訊工程學系教授
    分  機:33120
    E-mail:ythuang@cs.ccu.edu.tw
     
    助 理:吳顯如
    單 位:資工所
    分  機:----
    E-mail:zuzu7472@gmail.com

    參與學生:許峻漢
    系所:資訊工程系一年級

    參與學生:張水靈
    系所:生命科學系一年級

 

               

          本子計畫將培育國立中正大學資訊工程學系大一生許峻漢同學,以及生
  命科學系大一生張水靈同學,使他們具備鑽研生物資訊領域所需之專業知識
  與技能。許生和張生在高中時皆有優異的學業成績表現。許生曾開發出多項
  實用軟體,經推薦甄試進入資訊工程系就讀。此二位學生將由生命科學系李
  政怡教授與我共同指導。張生與許生在高中時皆就讀第三類組,對生命科學
  研究一直深感興趣。經深入訪談後,我們發現這二位同學的基礎生物知識與
  電腦知識相當紮實,且對生物資訊領域已有初步的瞭解,更展現出高度的興
  趣與熱誠。許生與張生各自在大一專業科目的表現都相當傑出。在資訊系和
  生科系系今年大一的新生中,他們為此跨學門培育計畫之最佳候選人。生物
  資訊是橫跨生命科學、資訊科學、與統計科學之跨領域研究學門。藉由我們
  所設計之培育計畫,這二位同學將可學習到生物資訊所需之跨領域知識和技
  能,成為一個能從事生物資訊研究之優秀人才。
 
          許生與張生將由李政怡教授和我親自指導,並會加入我們的實驗室並與
實驗室之成員開會、討論、與合作。我們的培育計畫首先將會教導分子生物
  學、遺傳學、資料結構、演算法、統計測試方法、與統計學習理論之基本知
  識。在第一年,除了基礎知識外,我們亦將指導他們閱讀與 “DNA拷貝數多
  型性” (Copy Number Polymorphisms; CNP) 相關之文獻,瞭解DNA拷貝數多型
  性之成因,並認識如何由微陣列晶片之訊號,設計演算法與統計方法來推測
  出拷貝數多型性。在第二年,我們將進一步教導兩位同學各種連鎖不平衡(Li-
nkage Disequilibrium; LD)之統計測量方法,藉以分析DNA拷貝數多型性連鎖
不平衡之程度。我們將探討不同DNA拷貝數對各種遺傳性疾病所造成之影響。
  經由二年的訓練,我們預期此二位同學會對生命科學、資訊科學、與統計學
  具備充足的知識與技能,並能針對拷貝數多型性作深入之研究。

此計畫需要跨系所之合作以實驗驗證我們預測出之拷貝數多型性。藉由
“定量聚合酵素鏈鎖反應” (Quantitative Polymerase Chain Reaction) 之實驗,可
驗證我們演算法所推測出DNA片段的真實拷貝數目。藉由熒光原位雜交技術
(Fluorescence in situ hybridization; FISH),可進一步得知所有DNA拷貝數多型性
在染色體中之位置。本校之生命科學系、化學工程系、分子生物研究所可以
配合進行這些驗證實驗。而我們所推測出之DNA拷貝多數型性之位置與數目
,更可藉由跨系所合作進行複雜之疾病關連式分析。

中正大學之生命科學系、化學工程系、與資訊工程系已經合作成立了功
能性基因體學程,每年暑假亦會舉辦生物資訊短期訓練課程。我們會引導該
生選修各系所配合這些學程所開授之相關課程。我們相信該生將會在此計畫
兩年的訓練後,具備完整的生物資訊所需之跨領域知識與技能。
 
 

 

更新日期:2008年9月12日